腾讯健康组学平台 组学环境简介

组学平台的正常运行依赖于底层云环境资源的支持(包含计算资源如容器服务 TKE Serverless、存储资源对象存储 COS、文件存储 CFS 等),准备好相关云资源后,组学平台可以快速、便捷、高效地帮助你利用选定的腾讯云资源进行组学相关数据分析。因此,在正式开始分析任务之前,需要在腾讯云创建运行环境。在展开分析任务时,可以以根据需要选择合适的环境运行你的应用。使用组学环境,需要先在 腾讯健康组学平台 申请开通组学平。

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腾讯健康组学平台 产品页,含版本规格、价格与购买入口。

一、申请开通组学平台

腾讯健康组学平台环境管理相关功能均通过 控制台 进行访问,团队管理员可在控制台环境管理页执行环境的新建、查看、删除等操作。

在环境管理页面,单击前往申请,跳转至 腾讯健康组学平台申请 页面,完善相关信息(联系方式、公司名称等),提交申请后,我们会尽快完成审核,审核结果会通过短信和站内信发送。同时,为了提供更好的服务,我们的架构师会与你联系。

二、组学环境选型

根据提供计算资源类型,组学环境分为组学容器环境和组学 HPC(高性能计算)环境两种类型,你可以根据用云习惯和资源使用需求来进行选择,选定环境类型后,可根据资源使用模式进一步选型,详情如下。

三、组学容器

·组学容器环境简介

组学容器环境底层依托原生 Kubernetes 打造容器化环境,提供以容器为核心且高度可扩展的高性能容器管理服务。同时,腾讯云容器服务不仅完全兼容原生 Kubernetes API,为容器化应用提供部署、调度等全套功能,解决环境一致性难题,提升集群管理便捷性并降本增效,还对 WDL、Nextflow、Snakemake 这三大主流生信工作流引擎提供原生支持,全方位适配组学生信工作流程。

·组学容器环境选型

针对用户对于资源使用的不同程度的托管需求,组学平台提供两种容器环境类型供选型:组学容器-托管环境和组学容器-组学标准环境,选型可参考下表:

产品选型 组学容器-托管环境 组学容器-标准环境
特点 完全 Serverless一站式服务安全沙箱容器 支持管理节点网络互通全栈业务场景支持
管理节点 无管理节点费用,按实际任务运行时长计费 支持管理节点,计算资源按实际任务运行时常计费
应用场景 适用于高稳定性、规模化、弹性峰值的生产计算任务支持安全沙箱容器,提供测试隔离环境,便于开发调试 适用于生信分析全业务场景支持管理节点,计算资源按实际任务运行时长计费支持腾讯云同账号下产品之间网络通
工作流引擎 Nextflow、WDL、Snakemake Nextflow、WDL
批量投递 支持 支持
缓存管理 支持精细化缓存管理 支持一键清理
Call Caching 支持 支持

关于组学容器环境的使用,请参见 组学容器环境管理。

四、组学高性能计算(HPC)环境

组学 HPC 环境底层集成了腾讯云的计算、存储和分析能力,为用户提供高效、安全、可靠的基因测序分析服务。你可利用云上弹性计算资源,进行基因数据的组装、比对、标注等分析任务。支持 Slurm 等多种调度方式,按需高并发运行基因数据分析任务,更加匹配你在本地集群使用 SGE/Slurm 等调度引擎进行生信分析的习惯,实现无缝迁移上云。

关于组学高性能计算(HPC)环境的使用,请参见 组学高性能计算环境(HPC)管理。

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